БИОТЕХНОЛОГИИ

Группа исследователей, связанная с различными учреждениями в Аргентине, обнаружила хромосомные доказательства того, что люди жили в Южной Америке до 18 000 лет назад. Группа опубликовала документ, в котором объясняется...

С открытием синтетических стволовых клеток, более известных как индуцированные плюрипотентные стволовые клетки, регенеративная медицина произвела революцию. Эти синтетические стволовые клетки создаются путем перепрограммирования клеток взрослых пациентов, таких как клетки...

Сотрудничество исследователей из Университета Кобе, Токийского университета и Университета Тохоку успешно выявило и уничтожило дрожжевые гены Pichia pastoris для увеличения секреционной продукции полезных белков. Благодаря ряду процессов, связанных с...

Если вы хотите разгадать тайны Вселенной, вы, вероятно, подумаете о физике: астрономах, смотрящих в телескопы за далекими галактиками или экспериментаторах, разбивающих частицы в Большом адронном коллайдере.Когда биологи пытаются разгадать...

Для российской фармацевтической отрасли самым острым вопросом сегодня является переориентирование на импортозамещение и поиск новых путей взаимодействия с зарубежными поставщиками и партнерами. Эта ситуация как ставит новые вызовы, так...

Согласно новому исследованию из Университета штата Мэн, наноцеллюлоза может помочь увеличить урожай черники при использовании с жидким удобрением, применяемым к листьям.Наноцеллюлоза, природный полимер из деревьев и растений со многими...

Трехмерная структура имеет решающее значение для функционирования многих биомолекул поэтому ученых более всего интересует пространственная структура биомолекул, а не только последовательность их отдельных строительных блоков. С помощью искусственного интеллекта (ИИ) биоинформатики могут достоверно оценить трехмерную структуру белка по всей аминокислотной последовательности. Однако применительно к молекулам РНК эта технология все еще находится на начальном уровне. Исследователи из Рурского университета в Бохуме (RUB) описывают способ использования Ии для достоверной оценки структуры определенных молекул РНК на основе нуклеотидных последовательностей в журнале PLOS Computational Biology от 7 июля 2022 года. Они сотрудничали с профессором Акселем Мосигом по специальности "Биоинформатика" Центра диагностики белков в Бохуме для работы группы во главе с Вивианом Бранденбургом и профессором Францем Нарберхаусом из Департамента микробиологии в Рубеже. Как отмечают специалисты, следует учитывать клеточную среду, где РНК часто рассматривается только как посредник между геномной ДНК и белками. Однако, многие молекулы РНК берут на себя функции клеток. Определяющим здесь является их пространственная структура. Подобные области в нуклеотидной последовательности могут быть сгруппированы вместе для формирования трехмерных структур. Идентификация этих конструкций в последовательности РНК представляет собой фактически математическую головоломку. Для этой головоломки существует биофизическая модель с соответствующими алгоритмами прогнозирования. Однако модель не может учитывать клеточную среду рнк, что также влияет на процесс ее сгибания. Если бы РНК располагалась в идеальной среде, модель могла бы предсказать структуру с высокой степенью точности - отмечают специалисты. Но живая клетка содержит много других компонентов. Здесь вступает в игру искусственный интеллект, который позволяет изучать тонкие закономерности клеточной среды на основе известных структур. Затем он может включить эти результаты в свои структурные прогнозы. Однако для процесса обучения ИИ необходимы достаточные данные об образовании, и на практике этого недостаточно. Получение данных обучения с помощью трюка Чтобы решить проблему неполных данных обучения, команда из Бохума применила трюк: исследователи работали с известными структурными мотивами рнк. Используя какую-то обратимую передачу, они могут генерировать практически любое количество нуклеотидных последовательностей, которые будут складываться из энергетических моделей этих структур в эти пространственные структуры. Благодаря этому так называемому обратному сгибанию исследователи создали большое количество нуклеотидных последовательностей и пар структур, с помощью которых они могли бы обучать ИИ. Новые структуры можно достоверно оценить. Затем исследователи поставили перед ИИ новый вызов: он должен был предсказать структуру определенных молекул бактериальной РНК. Эти молекулы, называемые терминаторами транскрипции, являются важными признаками конструкции.

Междисциплинарная команда биологов, химиков и инженеров из Университета Портсмут была первой, кто успешно выращивал чрезвычайно выносливые биоматериалы, вдохновленные моллюсками. Декан из Университета Портсмута был первым, кто успешно выращивал биоматериалы,...