Пятница, 24 марта, 2023
Новости биотехнологий
No Result
View All Result
No Result
View All Result
Новости биотехнологий
No Result
View All Result
Home Синтетическая биология

Live-seq: секвенирование клетки без ее уничтожения

28.02.2023
Синтетическая биология
0
Live-seq: секвенирование клетки без ее уничтожения
10
VIEWS
Share on FacebookShare on Twitter

Секвенирование РНК позволяет ученым изучать экспрессию генов в клетке. Поскольку информационная РНК (мРНК) генерируется из гена ДНК, эту информацию можно использовать для идентификации исходной последовательности генов и, таким образом, для измерения активности тысяч генов (то есть транскриптома) в этих клетках.
Задача секвенирования РНК состоит в том, чтобы захватить мРНК из определенной клетки из смешанной популяции — так существует большинство клеток в природе. Для этого ученые разработали «секвенирование одноклеточной РНК» (scRNA-seq), которое предоставляет беспрецедентную информацию для фундаментальных и биомедицинских исследований и даже для разработки лекарств.
Теперь группа ученых, профессор Барт Депланке из EPFL и Джулия Форхолт из ETH Zurich, решили проблему scRNA-seq: необходимость лизиса (уничтожения) клеток. Доктор. Ванзе Чен (EPFL) и доктор. Исследователи во главе с Ораном Гийомом Жантилем (ETH Zurich) представляют Live-seq. Инновационный подход поддерживает жизнеспособность клеток во время высвобождения РНК для дальнейшего изучения, а также является минимально инвазивным.
Ключом к Live-seq является метод микроскопии, называемый жидкостно-силовой микроскопией (FluidFM), который использует каналы тоньше человеческого волоса для манипулирования небольшими объемами жидкости (фемтолитрами) в образце под микроскопом, разработанный в ETH Zurich много лет назад. Таким образом, FluidFM позволяет пользователям вводить вещества в отдельные клетки или удалять цитоплазму, включая мРНК, из отдельных клеток без необходимости их разрушения.
Решающий успех, который привел к Live-seq, произошел, когда исследователям удалось сохранить и прочитать мрнк (по транскрипту) из этих небольших количеств цитоплазматического образца. В результате Live—seq теперь может связывать транскрипт клетки в данный момент времени с ее последующим молекулярным или фенотипическим поведением, то есть отслеживать активность тысяч генов в клетке в отдельные моменты времени — то, что ученые называют временным анализом транскриптов.
С помощью Live-seq теперь можно однозначно ответить на очень интересные и актуальные с биомедицинской точки зрения вопросы, например, почему некоторые клетки дифференцируются и почему сестринские клетки этого не делают, или почему некоторые клетки устойчивы к лекарствам от рака, а сестринские клетки — нет.
При тестировании Live-seq исследователи показали, что он может точно распознать различные типы и состояния клеток, не вызывая серьезных нарушений. В качестве доказательства концепции они использовали свою новую платформу для непосредственного картирования «траектории» отдельных иммунных клеток (макрофагов) до и после их активации, а также до и после жировых стромальных клеток (тип стволовых клеток) они дифференцировались в жировые клетки. Наконец, команда использовала Live-seq в качестве транскриптомного регистратора, что позволило им предсказать, насколько сильно — или слабо — иммунная клетка будет реагировать на иммунологический вызов.

Предыдущий

Методика готовых к использованию клеток продемонстрирована в исследованиях

Следующий

Технология импульсного света эффективно убивает вредные патогены

  • Конфиденциальность
Создание сайта Get-Going.ru

© 2021-2023 Новости биотехнологий

  • БИОИНФОРМАТИКА
  • БИОБЕЗОПАСТНОСТЬ
  • НАНОБИОТЕХНОЛОГИИ
  • СИНТЕТИЧЕСКАЯ БИОЛОГИЯ
  • ОТРАСЛЕВЫЕ БИОТЕХНОЛОГИИ
  • ИСКУССТВЕННЫЙ ИНТЕЛЛЕКТ
  • СТАРТАПЫ
  • COVID-19

© 2021-2023 Новости биотехнологий

Welcome Back!

Login to your account below

Forgotten Password?

Create New Account!

Fill the forms below to register

All fields are required. Log In

Retrieve your password

Please enter your username or email address to reset your password.

Log In
Просматривая этот сайт, вы соглашаетесь с нашей Политикой конфиденциальности