РНК-секвенирование предлагает способ предсказать реакцию отдельного пациента на популярное противораковое лекарственное средство рамуцирумаб.
Исследователи из Московского физико-технического института и их коллеги разработали первую методику персонализации терапии рака желудка на основе РНК-секвенирования опухолевых клеток. Исследование, поддержанное Российским научным фондом, было опубликовано в журнале Cold Spring Harbor Molecular Case Studies.
Рак желудка является пятым по смертности онкологическим заболеванием. Это редко диагностируется на ранних стадиях, что усложняет лечение. Есть несколько вариантов лечения, которые основаны на химиотерапии и терапевтических антителах. Тем не менее, реакция пациента часто непредсказуема, поэтому требуется индивидуальная терапия с назначением лекарств с учетом индивидуальных случаев.
Проблемные рецидивирующие опухоли желудка лечат терапевтическими антителами. Они блокируют рецепторы на поверхности клеток, которые отвечают за получение стимулирующих рост сигналов. Без них деление клеток прекращается и опухоль не увеличивается в размерах. Предотвращение роста кровеносных сосудов особенно важно, поскольку они снабжают опухоль питательными веществами и кислородом. Рамучирумаб представляет собой терапевтическое антитело, используемое для разрушения роста кровеносных сосудов в опухолевой ткани. Эффективность этого препарата широко варьируется от пациента к пациенту.
Биоинформатики МФТИ и их коллеги из медицинских исследовательских центров и отрасли предложили использовать данные пациента об уровнях экспрессии генов при раке для оценки эффективности рамуцирумаба в каждом отдельном случае.
«Это практически первый опубликованный случай успешного назначения [рамуцирумаба] пациентам с раком желудка, который был не случайным, а скорее основан на анализе молекулярных маркеров, которые мы отслеживаем на основе секвенирования РНК», – сказал Максим Сорокин, старший научный сотрудник Лаборатория трансляционной геномной биоинформатики МФТИ и заведующий отделом биоинформатики в Oncobox.
В сочетании с информационными технологиями современные методы молекулярной биологии позволяют исследователям собирать качественные данные о экспрессии каждого гена в клетке. Анализируя эти данные, можно найти ключ к диагностике онкологических заболеваний и прогнозированию эффективности их лечения.
Исследование, о котором сообщается в этой статье, было соавторами исследователей из МФТИ, Университета им. Сеченова, Института биоорганической химии им. Шемякина-Овчинникова РАН, Национального медицинского исследовательского центра онкологии им. Блохина, Клинического центра Витамеда, Московского областного научно-исследовательского клинического института им. В. В. Владимира и Oncobox.
Источник: eurekalert.org
Фото: Adobe